Система рецензирования содержит 2 уровня:

1. Поступившая в редакцию рукопись оценивается главным редактором или редакционным советом на соответствие профилю журнала и определение тематического раздела (рубрики), в котором она может быть опубликована.

2. Открытое рецензирование. Рецензент – специалист в рассматриваемой тематике и автор знают друг о друге. В случае отрицательной рецензии либо по рекомендации редакционного совета журнала рукопись проходит третий уровень рецензирования.

Порядок рецензирования статей

1. Предварительное рецензирование.

1.1. Рассматривается соответствие названия статьи тематике групп специальностей,  рубрикам, заявленным в информации о журнале.

1.2. Рассматривается соответствие оформления и структуры статьи требованиям, изложенным в руководстве для авторов.

2. Рецензирование статей с целью их экспертной оценки

2.1. Статьи направляются на рецензирование известным специалистам по тематике рецензируемых материалов, имеющих в течение последних 3 лет публикации по тематике рецензируемой статьи.

В тексте рецензии рецензент кратко отмечает: степень актуальности решаемых задач, новизну и адекватность предлагаемых методов решения,  степень научной новизны результатов, степень практической значимости результатов,  стиль и грамотность изложения материала, степень структурированности статьи, соответствие названия теме исследования,- обоснованность результатов и выводов статьи. В заключении рецензент делает вывод  о возможности (целесообразности) опубликования статьи в журнале «Математическое и программное обеспечение систем в промышленной и социальной сферах»).

Редакция издания направляет копии рецензий в Министерство образования и науки Российской Федерации при поступлении в редакцию соответствующего запроса.

2.2. При заключении рецензента о невозможности опубликования статьи редакция направляет автору мотивированный отказ, в котором предлагается доработать статью, исправить ошибки или сообщается о невозможности (нецелесообразности) опубликования статьи.

2.3. После доработки статьи автором и устранении всех замечаний статья может быть опубликована

3. Все рецензии хранятся в редакции в течение 5 лет.